研究报告

疮痂病菌胁迫马铃薯块茎的转录组分析  

张春雨 , 张桂芝 , 李鑫 , 王鹏程 , 金光辉*
黑龙江八一农垦大学农学院,大庆, 163319
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2021 年, 第 19 卷, 第 6 篇   
收稿日期: 2020年02月28日    接受日期: 2020年03月06日    发表日期: 2021年06月02日
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摘要

疮痂病是目前国内危害马铃薯生产重要病害之一,为研究疮痂病菌胁迫条件下马铃薯块茎相关基因的表达差异,探究参与调控疮痂病抗性的基因,本研究采用 RNA-seq技术,对不同处理时间的马铃薯块茎的进行转录组分析。结果表明:各样品获得 5.95 Gb以上高质量碱基,且 Q30碱基百分比均在 94.14%以上,筛选到差异表达基因 8 081个,其中 4 384个上调表达基因,3 647个下调表达基因,显著富集到植物与病原物互作、苯丙烷生物合成以及植物激素信号转导等代谢途径,挖掘到抗性候选基因 15个。研究结果在一定程度上解析了马铃薯与疮痂病菌互作的分子机制并为后续深入研究提供基础数据。
 

关键词
马铃薯;RNA-seq;疮痂病;候选基因

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《分子植物育种》印刷版
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